Mechanizm podwójnej płatności ma przynosić korzyści dla przedsiębiorców. Firma, która zapłaci za towar korzystając z mechanizmu split payment nie będzie z założenia podlegała sankcji VAT-owskiej. Nie będą jej również dotyczyły odsetki za zwłokę. Dodatkowo, nie będzie mogła być pociągnięta do solidarnej odpowiedzialności podatkowej z dostawcą towarów. Zachętą dla przedsiębiorców ma być również możliwość obniżenia kwoty zobowiązania podatkowego, jeśli jego zapłata nastąpi z w całości z rachunku VAT w terminie wcześniejszym niż ustawowo określony.
Wątpliwości budzi fakt, że środki zgromadzone na rachunku VAT nie będą mogły być swobodnie wykorzystywane. Może to mieć negatywny wpływ na płynność finansową przedsiębiorstw. Dotychczas dysponowali oni całą kwotą, jaką otrzymywali od dostawców, aż do momentu, w którym kwota VAT musiała być przekazana do organów podatkowych.